EL PGA está conformado por un conjunto de programas y subprogramas que abarcan las etapas de construcción y de operación de los aprovechamientos, además de algunos programas especiales que tiene una ejecución permanente (que trascienden la etapa de obra).

La estructura de programas y subprogramas surge de Estudio de Impacto Ambiental, que es una metodología sistemática para encarar la identificación y caracterización de las posibles alteraciones del ambiente y para proponer medidas de mitigación de los impactos negativos y de potenciación de los positivos.

Entre los programas especiales y de la etapa de construcción, el PGA aborda 90 temáticas específicas. Para su mejor exposición, se han clasificado en 22 temas clave, considerando las áreas biótica, física y social.

La ejecución de algunos programas del PGA está a cargo del Comitente (Estado Nacional), otros de la UTE Represas Patagonia (contratista) y otros son de responsabilidad compartida entre ambos. En los casos correspondientes, el trabajo se articula con las autoridades respectivas de la provincia de Santa Cruz, con distintas instituciones del sistema científico argentino o con otros organismos del Estado Nacional o provincial.

El alcance territorial de los programas y subprogramas depende de cada uno en particular: algunos se ejecutan en zona de obra, otros en áreas específicas (por ejemplo, el programa de macá tobiano realiza campañas en zonas de cría y de invernada: lagunas de la meseta central y estuario), otros a nivel de cuenca y algunos –en general, los del área social- a nivel provincial.

El SIA AHRSC es un sistema integrado de información que organiza y asiste a la gestión ambiental del proyecto AHRSC. Fue diseñado a partir de un complejo sistema de información ambiental y de la ingeniería civil y electromecánica para conformar un todo funcional y dinámico para su consulta, accesibilidad y difusión.

El SIA contiene y distingue la información vinculada al PGA, estudios e informes, capas de información espacial en formato georreferenciado, datos y series estadísticas de los monitoreos de los programas y subprogramas y material audiovisual de los trabajos de campo.

Las tecnologías aplicadas a la información de datos espaciales (SIG) han permitido diseñar en el SIA, el subsistema del PGA con métodos eficientes para la producción y uso de los datos geográficos y no geográficos, facilitando la evolución y el crecimiento continuo de los programas y subprogramas. El SIA, es una gran base de datos que constituye el “core” del Observatorio AHRSC, una plataforma que provee las herramientas para la gestión del conocimiento interdisciplinar y participativo de la información ambiental del proyecto.

El SIA conforma una Infraestructura de Datos Espaciales (IDE), un nodo dentro en una amplia red que distribuye información a partir de protocolos internacionales y que permite generar canales de comunicación y trabajo participativo fortaleciendo las vinculaciones interinstitucionales generadas por el proyecto y facilitadas desde la plataforma del Observatorio.